​- برنامج المناقصات لقسم الشراء الموحد باستخدام نظام ORACLE وهو أول نظام تم الربط به بحيث يتيح للدول والمستشفيات المشاركة في مناقصات الشراء الموحد من إدخال كمياتها الابتدائية و النهائية  (2007) .
- برنامج تقييم العينات : والخاص بتقييم المستحضرات الصيدلانية , حيث يتم أرسال هذا التقييم إلى قاعدة بيانات المكتب التنفيذي من أجل الاسترشاد بها أثناء عمليات البت والرسية الخاصة بمناقصات الشراء الموحد(2008) .
- برنامج التسجيل الدوائي التابع لقسم التسجيل المركزي والذي يتم من خلاله تسجيل جميع الشركات المسجلة مركزياً والأدوية كذلك على حد سواء , وإصدار الشهادات (2009) . 
- برنامج العمالة الوافدة لدول مجلس التعاون والذي من خلاله يتم اعتماد المراكز الطبية لفحص العمالة الوافدة لدول المجلس وكذلك التحقق من صحة الشهادت المصدرة لهذه العمالة ومعرفة حالتها لائق/غير لائق (2012) .

- ويجري العمل حالياً نحو تطبيق نظام الترصد والإنذار المبكر للأوبئة والأمراض على مستوى دول المجلس.